Uma das principais vantagens e que torna o Magento Commerce tão difundido em todo o mundo é o fato de ele ter sido concebido para receber módulos para Magento e funcionalidades complementares independentes.

Sua estrutura e arquitetura da informação possibilita a criação de módulos personalizados com infinitas possibilidades. O melhor de tudo é que, por estar preparado desta maneira, um módulo pode ser instalado em centenas ou milhares de lojas sem alterar o seu funcionamento. Isso possibilita que desenvolvedores e empresas do mundo todo crie módulos complementares e comercializem com preços relativamente baixos, pois o ganho está na escala vendida e não em uma unidade.

Isso também permitiu uma segmentação do mercado de tal forma que existem empresas que apenas criam e comercializam módulos para o Magento. Os módulos para Magento também podem ser adquiridos através do Magento Connect, que é um canal oficial do Magento que centraliza a comercialização desse tipo de aplicação.